À Lyon (latitude 45,75°N), les horaires de prière varient de façon notable au fil des mois, bien que l'amplitude soit moins marquée qu'à Paris. Le Fajr oscille entre 4h en été et 6h45 en hiver, tandis que le Maghrib varie entre 21h20 et 17h15 selon la saison. Les fidèles des 7e, 8e, 9e arrondissements et des communes de Vénissieux, Villeurbanne et Vaulx-en-Velin consultent ces horaires pour organiser leurs cinq prières quotidiennes. Les temps de prière sont calculés selon la méthode UOIF, référence reconnue par la Grande Mosquée de Lyon.
Lyon et sa métropole comptent plusieurs dizaines de lieux de culte musulmans, de la Grande Mosquée du 7e aux salles de prière de banlieue. La prière du vendredi attire chaque semaine des milliers de fidèles dans les mosquées de la région. Pour les musulmans de l'agglomération lyonnaise, l'aéroport Saint-Exupéry permet des départs vers la Omra tout au long de l'année. Omra Compare référence les agences agréées avec départ depuis Lyon et les principales villes d'Auvergne-Rhône-Alpes.